Lĩnh vực công nghiệp ô tô sẽ ảnh hưởng rất lớn đối với việc nước này sẽ rời khỏi EU, các hãng xe có nhà máy sản xuất đặt tại nước Anh sẽ có khả năng mất đi một khoản lợi nhuận lớn. Theo các nhà phân tích, việc Anh rời Liên minh châu Âu sẽ khiến cho các hoạt động kinh doanh và thương mại hạn chế rất nhiều. Đặc biệt, nhiều lao động nước ngoài đang làm việc tại các nhà máy sản xuất ô tô tại Anh có thể ngừng làm việc. Cụ thể, theo quy định hiện hành, các công nhân lao động có hộ chiếu EU đều có thể làm việc tại Anh nhưng không cần phải xin giấy phép lao động. Ngược lại, nếu nằm ngoài EU, thì các lao động phải đáp ứng được những yêu cầu khá nghiêm ngặt thì mới được cấp thị thực và làm việc tại Anh.

Vấn đề ảnh hưởng lớn nhất ở đây chính là ngành công nghiệp vận tải, ô tô nhiều khả năng sẽ phải chịu thêm thuế xuất khẩu. Chính vì thế, các mẫu xe được sản xuất tại Anh Quốc và xuất khẩu ra nước ngoài sẽ khó cạnh tranh hơn bởi phải chịu thêm thuế xuất khẩu. Đồng thời, các mẫu xe ở các nước khác nhập khẩu vào Vương quốc Anh cũng phải chịu thêm thuế nhập khẩu, điều này có thể khiển giá xe bán ra trên thị trường có thể tăng lên.

Theo số liệu thống kê thì có tới khoảng 80% xe được lắp ráp tại nước Anh và được xuất khẩu ra nước ngoài vào năm 2015. Trong đó, 1,5 triệu xe ô tô lắp ráp tại Anh thì có tới 58% được xuất khẩu ra nước ngoài, vì vậy việc Anh quyết định rời khỏi EU có thể khiến EU tăng thuế lên 10% trên các mẫu xe nhập khẩu. Bên cạnh đó, các phụ tùng ô tô xuất khẩu cũng có thể bị áp mức thuế xuất khẩu khoảng 2,7%.

Điểm qua những hãng xe có thể ảnh hưởng trực tiếp khi Anh rời khỏi EU, đầu tiên là Jaguar Land Rover, nhà sản xuất ô tô lớn nhất nước Anh, lợi nhuận hàng năm của hãng này có thể giảm khoảng 1 tỉ bảng Anh, tương đương 1.470.000.000 USD. Bên cạnh đó, các thương hiệu ô tô khác cũng bị ảnh hưởng như GM, bởi Anh cũng là thị trường lớn đứng thứ 4 của GM và cũng là thị trường ô tô lớn nhất của GM tại châu Âu. Toyota, Nissan, Ford và Honda đều ảnh hưởng. Các hãng xe sang khác như Bentley, Jaguar Land Rover hay MINI và Rolls-Royce cũng bị ảnh hưởng.