Là tổng công ty nhà nước nhưng từ năm 1989 đến nay Petrolimex không nhận được thêm vốn đầu tư từ ngân sách nhà nước - đây là điểm yếu được Công ty Chứng khoán Sài Gòn (SSI) đưa lên hàng đầu khi phân tích SWOT (thế mạnh, điểm yếu, cơ hội, thách thức) đối với hoạt động của Tổng công ty Xăng dầu.