Ngày 11 tháng 9, Chi cục Bảo vệ môi trường (Sở tài nguyên và môi trường Hà Nội) đã làm việc với Công ty cổ phần Môi trường đô thị và công nghiệp Urenco 10 và Công ty cổ phần Bóng đèn phích nước Rạng Đông, để thống nhất phương án xử lý, tẩy độc trong và ngoài khu vực cháy.
Theo đó, các đơn vị thống nhất trong tối 11 tháng 9, Công ty Urenco 10 sẽ tiến hành thu dọn mặt bằng khu vực cháy, để Viện Hóa học môi trường quân sự tiến hành công tác cô lập và xử lý hơi thủy ngân trong khu vực kho cháy trong ngày 12 tháng 9.