Sau khi Bộ Công Thương, Bộ Tài chính có ý kiến, Kiểm toán Nhà nước cho hay, đã điều chỉnh không tiếp tục đề nghị SABECO nộp ngân sách nhà nước, số tiền hơn 2.495 tỷ đồng lợi nhuận chưa phân phối, đến ngày 31 tháng 12 năm 2016.
Tại thời điểm kiểm toán, việc kiến nghị của Kiểm toán Nhà nước đối với SABECO, khi đó là doanh nghiệp có vốn góp của Nhà nước chiếm 89,59% vốn điều lệ, là phù hợp với các quy định về trách nhiệm của người đại diện phần vốn Nhà nước, tại công ty cổ phần có vốn góp chi phối của Nhà nước”.
Tuy nhiên, Kiểm toán Nhà nước cho biết, ngày 18 tháng 12 năm 2017 (sau thời điểm kết thúc kiểm toán), Bộ Công Thương đã bán đấu giá 343 triệu cổ phiếu, do Nhà nước sở hữu, tương đương 53,59% vốn điều lệ của SABECO cho Công ty trách nhiệm hữu hạn Việt Nam Beverage.